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醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)/細(xì)胞核基因組

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醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)基礎(chǔ)

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每條染色體含1個DNA分子,1個細(xì)胞的全部遺傳信息基因)都編碼在線狀的DNA分子上。由于每個體細(xì)胞中有2套染色體(2n),故所含的DNA是由兩個基因組(genome)構(gòu)成。每個單倍體基因組約含3.2×109bp。人類基因的平均長度為1-1.5kb,所以基因組以足以編碼1.5×106蛋白質(zhì),但實(shí)際上編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因只不過5萬-10萬個,僅占總基因組的2%-3%。其余的DNA順序包括基因之間的間隔順序、基因內(nèi)插入順序、重復(fù)順序等。目前,對它們的功能知之甚少,絕大多數(shù)重復(fù)順序只不過是過剩的DNA。但是,其中一些則有著特殊的功能,包括:調(diào)節(jié)基因的表達(dá),增強(qiáng)同源染色體之間的配對和重組,維持染色體結(jié)構(gòu),調(diào)節(jié)前mRNA的加工以及參與DNA的復(fù)制等。

(一)單一順序

單一順序(uniquesequence)約占基因組的60%-65%,這種順序在一個基因組中一般僅有單個或幾個拷貝,大多數(shù)編碼蛋白質(zhì)和酶基因?qū)儆诖祟?。單一順序還以間隔順序和散在分布在重復(fù)順序構(gòu)成側(cè)翼。

(二)重復(fù)順序

重復(fù)順序(repetitivesequence)是指在一個基因組中有很多拷貝,又可分為幾類:

1.高度重復(fù)順序(highly repetitive sequence) 其長度可能2、4、6、8等幾個bp,較長的順序可達(dá)200bp,但是重復(fù)拷貝數(shù)可達(dá)106次以上,例如染色體著絲粒、端粒和Y染色體長臂上的異染區(qū)就是由高度重復(fù)順序的衛(wèi)星DNA(satellite DNA)構(gòu)成的,高度重復(fù)順序不能轉(zhuǎn)錄,它們參與染色體結(jié)構(gòu)的維持,形成結(jié)構(gòu)基因間隔,可能與減數(shù)分裂時同源染色體的聯(lián)會配對有關(guān)。

2.中度重復(fù)順序(moderately repetitive sequence) 其長度300-7000bp,一般都是不編碼的順序。據(jù)認(rèn)為在基因調(diào)控中起重要作用,包括開啟或關(guān)閉基因,促進(jìn)或終止轉(zhuǎn)錄,DNA復(fù)制的起始,參與前mRNA加工等。例如人類Alu家族(Alu family),占人類基因組的3%-6%,由300bp構(gòu)成,在第170位附近都AGCT順序,可被內(nèi)切酶AluⅠ所切割(AG↓CT)故得名。這些順序在基因中重復(fù)達(dá)30-50萬次,平均5kbDNA就有一個Alu順序。此外還有KpnⅠ家族(KpnⅠfamily),約占基因組的3%-6% ,由3000-4800個拷貝構(gòu)成,其功能不詳。此外,還有小衛(wèi)星DNA和微衛(wèi)星DNA(參閱第十三章)。

3.基因家族基因簇真核基因組中有許多來源相同.結(jié)構(gòu)相似.功能相關(guān)的基因,這組基因稱為基因家族(genefamily)?;蚣易宓某蓡T可以分布于幾條不同染色體上,也可集中于一條染色體上。集中成簇的一組基因稱為基因簇(gene cluster)。例如人類白細(xì)胞抗原(HLA)系統(tǒng)的7個連鎖基因座位,排列成A-C-B-D-DR-DQ-DP,形成一個基因簇。此外,人類的類α和β珠蛋白基因簇分別集群串聯(lián)排列于16p13和11p15上,而組蛋白基因簇則群集于7q32-q36。有些基因家族的成員并不集中排列為基因簇,而是散布在基因組中不同部位,如微管蛋白基因家簇,微管相關(guān)蛋白2(MAP2)定位于2q34-q35,微管相關(guān)蛋白tau,β(MAPT1)定位于17q21,微管相關(guān)蛋白tau-2(MAPT2)定位于6q21。

(三)假基因

在基因家族中的某些成員并不產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物,稱為假基因(pseudogene),如Ψξ、Ψα、Ψβ等。假基因起始也可能有功能,后來由于缺失、倒位或點(diǎn)突變等原因使這些基因成為無功能的基因。假基因可以與有功能基因連鎖,也可以由于染色體易位或作為轉(zhuǎn)座子,從一部位移到另一新的部位。

此外,人類基因組中還有一些特殊的短順序位于各基因的側(cè)翼,它們是起到調(diào)控作用的調(diào)節(jié)順序(啟動子、增強(qiáng)子等)。有的是與細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān)的原癌基因(proto-onco-gene)等構(gòu)成了五花八門的人類基因組結(jié)構(gòu)。

32 人類基因組 | 線粒體基因組 32
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