物種
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物種（species）,簡稱“種”,是生物分類學研究的基本單元與核心。它是一群可以交配并繁衍后代的個體, 但與其它生物卻不能交配，不能性交或交配后產(chǎn)生的雜種不能再繁衍。Mayr1982年對物種進行了重新定義他認為物種是由居群組成的生殖單元和其它單元在生殖上是隔離的, 在自然界占據(jù)一定的生態(tài)位。
物種是生物分類學的基本單位。物種是互交繁殖的相同生物形成的自然群體，與其他相似群體在生殖上相互隔離，并在自然界占據(jù)一定的生態(tài)位。
對于植物而言，二倍體小麥與四倍體小麥之間雖然不能得到可育的后代，但他們屬于同一物種中的不同亞種?！ ?/p>
物種研究
讀音:wu zhong
研究生物分類的方法和原理的生物學分支。分類就是遵循分類學原理和方法，對生物的各種類群進行命名和等級劃分。分類學曾被稱為系統(tǒng)分類學，但它與系統(tǒng)學很易混淆，系統(tǒng)學是研究生物的分異度（多樣性）以及它們中間的任何一個類群和其他所有類群的各種關系的科學，曾稱為分類系統(tǒng)學。三者的共同目的是從理論上和實踐上，闡明種類之間的關系（或親緣關系），建立自然系統(tǒng)，確定各類群的命名和排序，總結(jié)其進化歷史。
地球上現(xiàn)生的物種以百萬計，千變?nèi)f化，各不相同，如果不予分類，不立系統(tǒng)，便無從認識，難以利用。分類系統(tǒng)是生物種類的查找系統(tǒng)，可借以認識和查取有關資料。分類的對象是形形色色的種類，都是進化的產(chǎn)物；分類學在于闡明種類之間的歷史淵源，使建立的分類系統(tǒng)反映進化歷史。因而從理論意義上說，分類學是生物進化的歷史總結(jié)。
分類學是綜合性學科。生物學的各個分支，從古老的形態(tài)學到現(xiàn)代分子生物學的新成就，都可吸取為分類依據(jù)。分類學亦有其自己的分支學科，如以染色體為依據(jù)的細胞分類學（或染色體分類學），以血清反應為依據(jù)的血清分類學，以化學成分為依據(jù)的化學分類學，等等。動物、植物和細菌，作為三門分類學，各
有其特點；病毒分類則尚未正式采用雙名制和階元系統(tǒng)。
分類學歷史
人類在很早以前就能識別物類，給以名稱。漢初的《爾雅》把動物分為蟲、魚、鳥、獸4類：蟲包括大部分無脊椎動物；魚包括魚類、兩棲類、爬行類等低級脊椎動物及鯨和蝦、蟹、貝類等；鳥是鳥類；獸是哺乳動物。這是中國古代最早的動物分類，四類名稱的產(chǎn)生時期看來不晚于西周。這個分類，和林奈（1758）的六綱系統(tǒng)比較，只少了兩個綱（兩棲綱和蠕蟲綱）。
古希臘哲學家亞里士多德采取性狀對比的方法區(qū)分物類，如把熱血動物歸為一類，以與冷血動物相區(qū)別。他把動物按構(gòu)造的完善程度依次排列，給人以自然階梯的概念。
17世紀末葉，英國植物學者J．雷曾把當時所知的植物種類，作了屬和種的描述，所著《植物研究的新方法》（1682）是C．林奈以前的一本最全面的植物分類總結(jié)。J．雷還提出“雜交不育”作為區(qū)分物種的標準。
近代分類學誕生于18世紀，它的奠基人是瑞典植物學者林奈。林奈為分類學解決了兩個關鍵問題：①建立了雙名制，每一物種都給以一個學名，由兩個拉丁化名詞所組成，第一個代表屬名，第二個代表種名。例如Panthera tigris是虎的學名，Bombyx mori是蠶的學名。②確立了階元系統(tǒng)。林奈把自然界分為植物、動物和礦物三界，在動植物界下，又設有綱、目、屬、種四個級別，從而確立了分類的階元系統(tǒng)。每一物種都隸屬于一定的分類系統(tǒng)，占有一定的分類地位，可以按階元查對檢索。并首先在1753年印行的《植物種志》和1758年版《自然系統(tǒng)》中應用于植物和動物。這兩部經(jīng)典著作，標志著近代分類學的誕生。
林奈相信物種不變，他的《自然系統(tǒng)》沒有親緣概念，其中6個動物綱是按哺乳類、鳥類、兩棲類、魚類、昆蟲、蠕蟲的順序排列的。J．－B．de拉馬克把這個顛倒了的系統(tǒng)撥正過來，從低級到高級列成進化系統(tǒng)。他還把動物區(qū)分為脊椎動物和無脊椎動物兩類，并沿用至今。但是，由于他的進化觀點在當時沒有得到
公認，因而對分類學影響不大。直到1859年，C．R．達爾文的《物種起源》出版以后，進化思想才在分類學中得到貫徹，明確了分類研究在于探索生物之間的親緣關系，使分類系統(tǒng)成為生物系譜——系統(tǒng)分類學由此誕生。
分類階元、命名模本方法和鑒定 分類系統(tǒng)是階元系統(tǒng)，通常包括7個主要級別：種、屬、科、目、綱、門、界。種（物種）是基本單元，近緣的種歸合為屬，近緣的屬歸合為科，科隸于目，目隸于綱，綱隸于門，門隸于界。隨著研究的進展，分類層次不斷增加，單元上下可以附加次生單元，如總綱（超綱）、亞綱、次綱、總目（超目）、亞目、次目、總科（超科）、亞科等等。此外，還可增設新的單元，如股、群、族、組等等，其中最常設的是族，介于亞科和屬之間。林奈晚年承認種內(nèi)有變種。通常種下分類，動物只設亞種單元；植物設亞種、變種、變型等單元；細菌設品系、菌株等單元。
列入階元系統(tǒng)中的各級單元都有一個科學名稱，表1是兩個簡化的例子。命名的單元——表上從家蠶到動物界，從馬尾松到植物界，不再是抽象的單元，而是含有實際種類的物類單元taxa。分類工作的基本程序就是把研究對象歸入一定的系統(tǒng)和級別，成為物類單元。所以分類和命名是分不開的。
種和屬的學名后常附命名人姓氏，以標明來源，便于查找文獻。表上家蠶，蠶蛾屬學名后的L．，是命名人林奈Linnaeus的縮寫，馬尾松學名后的Lamb．，是命名人蘭伯特Lambert的縮寫，通常除林奈等少數(shù)之
外，一般命名者姓名引用時不應縮寫。亞種命名采取3名制，即在屬名、種名后再加亞種名。例如華南虎和東北虎都是虎的亞種，前者的學名是Panthera tigris amoyensis Hilz-heimer，后者是Panthera tigris altaica Temminck。變種學名亦來取3名制，只是在種名與變種之間加上拉丁文變種varietas的縮寫var．，例如中華按蚊原先鑒定為赫坎按蚊的變種（現(xiàn)已分出為獨立的種）學名曾是Anopheleshyrcanes var．sinensis Wedemann。
分類名稱要求穩(wěn)定，一個屬或種（包括種下單元）只能有一個學名，如果有兩個或多個時，便是“同物異名”，必須于其中核定最早提出的學名，摒棄較后的異名。一個學名只能用于一個對象（屬或種），如果有兩個或多個對象者，便是“異物同名”，必須于其中核定最早的命名對象，而其他的同名對象則另取新名。這叫做“優(yōu)先律”，動物和植物分類學界各自制訂了《命名法規(guī)》，所以在動物界和植物界間不存在異物同名問題，如Cystiphyllum既是褐藻又是古生代珊瑚的屬名。“優(yōu)先律”是穩(wěn)定學名的重要措施。優(yōu)先律的起始日期，動物是1758年，植物是1820年，細菌則起始于1980年1月1日。
法規(guī)的另一重要規(guī)定是模本方法。凡發(fā)表新種（包括新屬和新亞種），必須指定一個標本作為命名的模式標本，叫做“正?！保喎Q模本。“副?！笔窃枋鏊鶕?jù)的其他標本，特別是和正模同時同地采得的標本；“配?！笔歉蹦Ｖ羞x取的與正模異性的標本。在模本遺失或未定的情況下，可以選取合適標本作為“新?！保源嬲?，一般要從原產(chǎn)地和原層位采集。與模本產(chǎn)地相同而在以后采得的標本可立為“地?！?。模式標本是鑒定的對照標本。
鑒定學名是取得物種有關資料的手段，即使是前所未知的新種類，只要鑒定出其分類隸屬，亦可預見其一定特征。分類系統(tǒng)是檢索系統(tǒng)，也是信息存取系統(tǒng)。許多分類著作，如基于區(qū)系調(diào)查的動植物志，記述某一國家或地區(qū)的動植物種類情況，作為基本資料，都是為鑒定、查考服務的。
物種概念與物種標準 物種指一個動物或植物群，其所有成員在形態(tài)上極為相似，以至可以認為他們是一些變異很小的相同的有機體，它們中的各個成員間可以正常交配并繁育出有生殖能力的后代，物種是生物分類的基本單元，也是生物繁殖的基本單元。物種概念反映時代思潮。在林奈時代，人們相信物種是不變的，同種個體符合于同一“模式”。模式概念（不同于模式標本），淵源于古希臘哲學的古老的概念，應用到整個分類系統(tǒng)，概念假定所有階元系統(tǒng)中的各級物類單元，都各自符合于一個模式。對神創(chuàng)論者來講，由各級模式所組成的物類階元，正好說明了“造物主”的智慧設計。模式概念亦是形態(tài)學概念，所謂模式是指形態(tài)模式——物種是由形態(tài)相似的個體所組成的，同種個體符合于同一形態(tài)模式。這是物種的形態(tài)學定義，也是形態(tài)學標準。另一物種標準是雜交不育。早在林奈以前，J．雷就明確指出，物種是繁殖單元，同種個體可以交配繁殖，異種之間則雜交不育，形成生殖隔離。生殖隔離和模式概念一樣，符合于物種不變的觀點，因為它突出了種間間斷，無視歷史連續(xù)。
林奈時代的物種概念，包含兩個基本內(nèi)容：①不變，②客觀存在。由于不變，而且是“上帝”所創(chuàng)造，物種當然是客觀存在。種內(nèi)形態(tài)同一，種間生殖隔離則是物種不變的兩個標準。達爾文的物種概念與此相反，它的基本內(nèi)容是：①變，②人為單元。進化論說明了物種是變的，變化中的物種否定了自身的存在。達爾文在《物種起源》內(nèi)說：“可見‘物種’這名詞，我認為是為了方便起見，任意地用來表示一群很相似的個體的，它在本質(zhì)上和‘變種’沒有區(qū)別”。達爾文不考慮物種定義，因為物種既是人為單元，便不可能有客觀標準，更不需要定義。他的進化論證明了種間的歷史連續(xù)，卻忽視了種間的間斷意義。
物種之變與不變曾經(jīng)是進化論和特創(chuàng)論的斗爭焦點，是勢不兩立的觀點。但是，分類學的事實說明，每一物種各有自己的特征，沒有兩個物種完全相同；而每個物種又保持一系列祖?zhèn)鞯奶卣?，?jù)之可以決定其界、門、綱、目、科、屬的分類地位，并反映其進化歷史。整個階元系統(tǒng)內(nèi)各級物類之間的特征關系，表現(xiàn)為祖征與新征的對立統(tǒng)一。界的特征，如細胞壁、葉綠體和光合作用之作為植物特征，對界下單元（門、綱、目、科、屬、種）來講，是祖征；而在界間對比，如植物界與動物界或真菌界對比，則又表現(xiàn)為各界的新征。界下的各級單元，從門到種，亦都如此。
林奈和達爾文的物種概念是個體概念——物種是一群相似的個體。20世紀30、40年代，隨著“新系統(tǒng)學”的發(fā)展，強調(diào)了群體概念。物種不是毫不相干的個體，而是以個體集合為大大小小的種群單元而存在的，物種是“種群”集團，種群是種內(nèi)的繁殖單元。分類學上當前流行的物種定義，就是以種群為單元的E．邁爾定義：“物種是由自然種群所組成的集團，種群之間可以相互交流繁殖（實際的或潛在的），而與其他這樣的集團在生殖上是隔離的”。定義沿用了生殖隔離的標準，它所突出的是群體概念。生殖隔離作為標準，只適用于有性物種，不適用于無性物種和化石物種。對于無性和化石物種，一般是從特征的間斷程度，以判斷種類劃分。一個比較籠統(tǒng)的定義：“物種是生命系統(tǒng)線上的基本間斷”，可以適用于一切物種。
分類工作的基本內(nèi)容是區(qū)分物種和歸合物種，前者是種級和種下分類，后者是種上分類。種群概念提高了種級分類水平，改進了種下分類，其要點是以亞種代替變種。亞種一般是指地理亞種，是種群的地理分化，具有一定的區(qū)別特征和分布范圍。亞種分類反映物種分化，突出了物種的空間概念。含有兩個或多個亞種的物種稱多型種，不分亞種的物種稱單型種。形態(tài)十分相似但生殖上隔離的物種稱姐妹種，又稱隱種。分布區(qū)域重疊的物種稱同地種，分布不重疊的物種稱異地種。地理亞種都是異地亞種，在交接區(qū)域常常有中間類型。
變種這一術(shù)語過去用得很雜，有的指個體變異，有的指群體類型，意義很不明確，在動物分類中已廢除不用。在植物分類中，一般用以區(qū)分居群內(nèi)部的不連續(xù)變體。生態(tài)型是生活在一定生境而具有一定生態(tài)特征的種內(nèi)類型，常用于植物分類。人工選育的動植物種下單元稱為品種。
由于種內(nèi)種間變異錯綜復雜，分類學者對種的劃分有時分歧很大。根據(jù)外部形態(tài)的異同程度作為劃分物種依據(jù)而劃分的稱為形態(tài)種，由于對各種形態(tài)特征的重要性認識不一，使劃分的種因人而異，尤其是分類學者對某些特征的“加權(quán)”常使它們比其他特征更具重要性，而造成主觀偏見。古生物種或化石種中的大多數(shù)是以形態(tài)特征為依據(jù)，甚至以硬組織，如外殼、骨骼等部分形態(tài)特征為依據(jù)而建立的，應歸于形態(tài)種的范疇。植物的各個部分常單獨保存為化石，某些不屬于同一科的生物，由于單獨保存的葉、根等，很難確立其系統(tǒng)關系，僅以形態(tài)相似而建立的屬為形態(tài)屬，如櫛羊齒（Pecopteris）等；其單獨保存的器官可構(gòu)成器官屬，如鱗木類的孢子葉化石叫鱗孢葉屬（Lepidostrobophyllum），孢子葉穗化石稱鱗孢穗屬（Lepidostrobus），而根座常被稱為Stigmaria。
另外，強調(diào)染色體數(shù)目（如二倍體、多倍體、無融合生殖種等）作為分種依據(jù)而將外部形態(tài)作為次要特征依據(jù)的稱為生物學種。
植物分類有大種和小種之分：“歸并派”主張大種概念，又稱“林奈種”，把種的范圍劃得較大，有時甚至很大，包括近緣種在內(nèi)；“細分派”主張小種概念，又稱“約爾丹種”，常把亞種、變種、生態(tài)型等劃分為種，種下不再分類。動物分類學亦有歸并和細分兩派，但不作大種和小種的區(qū)分。歸并派和細分派的存在，說明了分類學家對物種標準還缺少一致的認識。作為動物種，不同種間不能繁殖，但作為植物種則可以雜交而產(chǎn)生有繁殖能力的后代，如小麥。因此傾向于把二倍體作為種的代表。
這一切說明物種的概念及定義并未真正解決，同時，種上分類亦同樣有歸并與細分之爭，例如細分派把貓科分為28個屬，而極端的歸并派只承認一個屬。
系統(tǒng)原理和分類方法 一個物種或物類，以至整個植物界和動物界，都有自己的歷史。研究系統(tǒng)發(fā)育就是探索種類之間歷史淵源，以闡明親緣關系，為分類提供理論依據(jù)。盡管在分類學派中有綜合（進化）分類學、分支系統(tǒng)學和數(shù)值分類學3大流派，但在其基本原理上都有許多共同之處，不過各自強調(diào)不同的方面而已。系統(tǒng)分類的要求是：①共同起源。每一個物類都有一個起源的問題，要求同一系統(tǒng)內(nèi)的物種或物類必須是起源于共同的祖先的，這樣才能反映自然系譜。這叫做建立單系系統(tǒng)，單系是指一個物類起源于一個祖種。復系則指起源于兩個或多個祖種。分類學要求建立單系系統(tǒng)，不取復系系統(tǒng)。③分支發(fā)展。一個物類的產(chǎn)生最初總是少數(shù)，在理論上該是一個物種。從這個最初的祖種，通過分支發(fā)展，從少到多，形成為許多不同支系（圖1）。系統(tǒng)發(fā)展是分支發(fā)展的過程，分支關系反映親緣關系。圖1是簡化的系統(tǒng)樹，從A到H代表8個物種或物類，A和B的共同祖先在Ⅰ處，A和C的在Ⅱ處，A和F的在Ⅲ處。根據(jù)這種分支關系，W．亨尼希對親緣關系下了一個定義：當物種A和B來源于某一個共同祖先，而這個祖先卻不是物種C的祖先時，則A和B的關系要比A和C為近。因此，共同祖先的遠近，決定親緣關系的遠近。他指出，所謂單系類群“是一些或大或小的類群，其群內(nèi)的物種之間的相互關系比群外的任何物種為近”。例如，圖1中AB、CD、FG、CDE、FGH、ABCDE都是這樣的單系類群，而BCDE由于A的存在，DE由于C的存在，GH由于F的存在，都不是單系類群。這是亨尼希的、亦即分支系統(tǒng)學的嚴格的單系概念。③級進發(fā)展（或級序發(fā)展）。分支是橫的分化，級進是縱的上升，是生物從低級到高級的發(fā)展。分支與級進是相輔相成的。例如：硬骨魚類在分支發(fā)展中有一支演進為兩棲類，兩棲類在分支中有一支演進為爬行類，另一支演進為哺乳類，而鳥類和哺乳類，又再各自分支發(fā)展。所以分支中有級進，級進后再分支，系統(tǒng)發(fā)育是分支與級進的統(tǒng)一發(fā)展過程（分支與級進是相對的，大分支中有大級進，小分支中有小級進）。
假定圖1上的BCDE代表爬行動物的4個支系，A是由此分出的鳥類分支，按照階段級進的觀點，鳥類和爬行類的四支比較，代表進化的一個的階段，必須分列為獨立的一個生物群，以與其他4支相區(qū)別。這就是一般所采取的鳥綱與爬行綱并立的傳統(tǒng)分類，也就是所謂進化分類學的分類。進化分類學派認為這個分類并不違反單系系統(tǒng)的原則，因為鳥類（A）作為一個單元，源出于同一祖種，而爬行類的四個支（BCDE）作為另一單元，同樣是出于一個祖種。
分支學派把系統(tǒng)圖上從同一基點所分出的支系稱為姊妹群，圖1上如Ⅰ處分出的A和B兩支，Ⅱ處分出的AB和CDE兩支，以及Ⅲ處分出的ABCDE和FGH兩支都是姊妹群。姊妹群在分類上應列為同等級別，如果圖上A代表鳥類，BCDE代表爬行類4個支系，則A支應與B支同級，不能與BCDE四支同級。
這是當前系統(tǒng)分類學上的兩個學派的分歧：分支系統(tǒng)學派以宗譜分支為衡量親緣的唯一標準；進化分類學派則考慮兩個標準，宗譜分支和進化水平（階段改進）。分支與級進交錯發(fā)展，因而在分類工作中經(jīng)常會遇到一個和兩個標準的分歧，成為兩個學派的爭論交點。
特征對比是分類的基本方法。所謂對比是異同的對比：“異”（差異性）是區(qū)分種類的根據(jù)，“同”（相似性）是合并種類的根據(jù)。分析分類特征，首先要考慮反映共同起源的共同特征。但有同源和非同源的不同。例如鳥類的翼和獸類的前肢是同源器管，可以追溯到共同的祖先，是“同源特征”。恒溫在鳥獸是各別起源，并非來自共同祖先，是“非同源特征”。系統(tǒng)分類采用同源特征，不取非同源性狀。亨尼希把同源特征分為祖征和裔征兩類：祖征是來自較早祖先而在后代保持不變的特征；裔征是兩個姊妹支系來自最近祖先的派生特征，不見于較早祖先。每一物種或物類都是祖征和裔征鑲嵌，共同祖征是追溯歷史淵源的根據(jù)，共同裔征是建立單系的根據(jù)。進化分類學派亦要求采用同源特征，但不作特征分類。他們從共同性探索共同祖先，又從差異性衡量進化水平。上面提到鳥類和爬行類的問題，已知鳥類和鱷類最近緣，按照分支學派的分析，兩者具有共同的裔征（如內(nèi)鼻孔具次生腭，其他爬行類內(nèi)鼻孔無次生腭），在系譜上是一對姊妹支系，組成為一個單系群。但進化分類學派重視特征差距，他們根據(jù)鳥類具有羽毛、前肢特化為翼以及恒溫等特征，認為兩者差距很大，反映不同的進化階段，主張鳥類應與鱷目分開，而與爬行類（包括鱷目）并立為綱。這是兩個學派對特征衡量的分歧，也就是宗譜分支與進化水平的分歧。
分類特征反映進化歷史，系統(tǒng)分類要求從歷史觀點衡量特征價值。但特征衡量常會出現(xiàn)分歧，重視這一或那一特征，會得出不同的分類。在某些情況下，由于同源和非同源不易區(qū)分，衡量又會陷入循環(huán)論，如：共同的特征反映共同祖先，共同的祖先產(chǎn)生共同特征?；谶@些情況，為了促進分類的穩(wěn)定性和重復性，數(shù)量分類學主張“總體相似性”的觀點，其方法是：采用大量能以數(shù)值表示的特征，編成符號，運用電子計算機。求得相似性系數(shù)，作出分類。數(shù)量分類不先考慮親緣，但得出的結(jié)果在很多情況下和傳統(tǒng)分類近似。
生命現(xiàn)象的各個方面都可為分類提供特征，最常用的是形態(tài)，尤其是外部形態(tài)。但目前趨向愈來愈重視生理、生化、遺傳等方面的特征，如DNA（脫氧核糖核酸）的含量比較，蛋白質(zhì)的成分分析，染色體的祖型分析，以及植物化學成分、動物交配行為等等。如以蟋蟀鳴聲為特征，使原先單憑形態(tài)特征所未能區(qū)分的近緣種類得以鑒別。
生物的界級分類 林奈把生物分為兩大類群：固著的植物和行動的動物。兩百多年來，隨著科學的發(fā)展，人們逐漸發(fā)現(xiàn)，這個兩界系統(tǒng)存在著不少問題，但直到20世紀50年代，仍為一般教本所遵從，基本沒有變動。
最初的問題產(chǎn)生于中間類型，如眼蟲Euglena綜合了動植物兩界的雙重特征，既有葉綠體而營光合作用，又能行動而攝取食物。植物學者把它們列為藻類，稱為裸藻；動物學者把它們列為原生動物，稱為眼蟲。中間類型是進化的證據(jù)，卻成為分類的難題。為了解決這個難題，早在19世紀60年代，人們建議成立一個由低等生物所組成的第三界，取名為原生生物界（Protista），包括細菌、藻類、真菌和原生動物。這個三界系統(tǒng)解決了動植物界限難分的問題，但未被接受，整整100年后，直到20世紀60年代，才開始流行了一段時間，為不少教科書所采用。
生命的歷史經(jīng)歷了幾個重要階段，最初的生命應是非細胞形態(tài)的生命，當然，在細胞出現(xiàn)之前，必須有個“非細胞”或“前細胞”的階段。病毒就是一類非細胞生物，只是關于它們的來歷，是原始類型，還是次生類型，仍未定論。從非細胞到細胞是生物發(fā)展的第二個重要階段。早期的細胞是原核細胞，早期的生物稱為原核生物（細菌、藍藻）。原核細胞構(gòu)造簡單，沒有核膜，沒有復雜的細胞器。從原核到真核是生物發(fā)展的第三個重要階段。真核細胞具有核膜，整個細胞分化為細胞核和細胞質(zhì)兩個部分：細胞核內(nèi)具有復雜的染色體裝置，成為遺傳中心；細胞質(zhì)內(nèi)具有復雜的細胞器結(jié)構(gòu)，成為代謝中心。由核質(zhì)分化的真核細胞，其機體水平遠遠高出于原核細胞。從單細胞真核生物到多細胞生物是生命史上的第四個重要階段。隨著多細胞體形的出現(xiàn)，發(fā)展了復雜的組織結(jié)構(gòu)和器官系統(tǒng)，最后產(chǎn)生了高級的被子植物和哺乳動物。
植物、菌類和動物組成為生態(tài)系統(tǒng)的3個環(huán)節(jié)。綠色植物（真核植物和原核藍藻）是自養(yǎng)生物，是自然界的生產(chǎn)者。它們通過葉綠素進行光合作用，把無機物質(zhì)合成有機養(yǎng)料，供應自己，又供應異養(yǎng)生物。菌類（細菌和真菌）是異養(yǎng)生物（自養(yǎng)細菌除外），是自然界的分解者。它們從植物得到食料，又把有機食料分解為無機物質(zhì)，反過來為植物供應生產(chǎn)原料。動物亦是異養(yǎng)生物，它們是消費者，是地球上最后出現(xiàn)的一類生物。即使沒有動物，植物和菌類仍然可以存在，因為它們已經(jīng)具備了自然界物質(zhì)循環(huán)的兩個基本環(huán)節(jié)，完成循環(huán)過程中合成與分解的統(tǒng)一。但是，沒有動物，生物界不可能這樣豐富多彩，更不可能產(chǎn)生人類。植物、菌類和動物代表生物進化的3條路線或3大方向。
以上是目前對生物進化的階段和方向的認識，是現(xiàn)代界級分類的根據(jù)。當前最流行的分類是一種五界系統(tǒng)。
五界系統(tǒng)反映了生物進化的3個階段和多細胞階段的3個分支，是有縱有橫的分類。它沒有包括非細胞形態(tài)的病毒在內(nèi)，也許是因為病毒系統(tǒng)地位不明之故。它的原生生物界內(nèi)容龐雜，包括全部原生動物和紅藻、褐藻、綠藻以外的其他真核藻類，包括了不同的動物和植物。不少學者認為，不必成立原生生物界，而把藻類和原生動物分別劃歸植物界和動物界，成為比較緊湊的四界系統(tǒng)。反之，亦還有不少人主張擴大原生生物界，把真菌劃歸在內(nèi)，成為另一種四界系統(tǒng)。
本卷采用六界系統(tǒng)。因為任何生物系統(tǒng)都應把病毒（連同類病毒）包括在內(nèi)。病毒是非細胞生物，但不一定代表生命的前細胞階段。六界分類系統(tǒng)，在病毒界和細菌界之間還加有問號；因為病毒如果是原始生物，細菌作為早期的原核生物，很可能起源于“原病毒”。原核生物的最早化石記錄，包括細菌和藍藻，見于30多億年前的地層中；真核生物的最早記錄，包括金藻和綠藻，見于14～15億年前的地層中。
自養(yǎng)的生產(chǎn)者藍藻和異養(yǎng)的分解者細菌組成為原核時代的兩大生態(tài)環(huán)節(jié)，正如植物、真菌和動物組成為真核生物的三大生態(tài)環(huán)節(jié)。這五類生物，基于它們的重要時空地位，都應獨立為界，連同病毒，綜合為六界分類系統(tǒng)。
藍藻顯然起源于細菌，是細菌的一支；真核植物大概起源于原核藍藻，是藍藻的一支（見細胞起源）。從真核植物又分支發(fā)展為真菌和動物（圖2）。一般說來，植物細胞有細胞壁和葉綠體，真菌細胞有壁無葉綠體，動物細胞無壁無葉綠體。如果把原核的藍藻和動植物的中間類型裸藻都歸在植物界內(nèi)，列為藍藻門和裸藻門。真菌和動物的中間類型粘菌，以及真菌和藻類共生的地衣，歸在真菌界內(nèi)，則可成為一種四界系統(tǒng)。
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